В начальный период соя растет очень медленно. За первые 20-25 дней после всходов растения достигают высоты 15- 20 см. Первый тройчатый лист образуется через 5-7 дней после появления всходов. Последующие листья в зависимости от сорта и условий выращивания появляются через 4-7 дней.
С появлением третьего - пятого листа начинается ветвление стебля. С этого времени стебель интенсивно растет вплоть до цветения, затем рост его почти прекращается, заканчивается и листообразование.
Цветение у скороспелых сортов сои начинается с появлением пятого-шестого листа, то есть в начале развития боковых побегов, а у позднеспелых - через 30-45 и более дней после всходов. Цветение у сои растянутое, продолжается 15-40 дней и больше и зависит от сортовых особенностей и погодных условий.
Начинается оно с цветков, размещенных в нижней части стебля, затем распространяется вверх по стеблю. В таком же порядке происходит плодообразование и созревание плодов.

Одновременно с цветением интенсивно растут стебель и листья, что создает напряжение в обеспечении растения водой и питательными веществами. Обычно через 10-14 дней после начала цветения в нижней части растения появляются бобы.
В период налива семян рост вегетативной массы прекращается, начинается отмирание нижних листьев. От цветения до начала созревания бобов проходит 40-60 дней.
Созревание семян длится 11-20 дней.
Соя - хорошо облиственное растение. Наибольшей величины площадь листьев достигает в период массового цветения и составляет 60-115 тыс. м2 и больше на 1 га.
В фазе полной спелости семян все листья опадают.
Корневая система сои растет медленнее, чем надземная масса. Корень углубляется в почву на 1,5-2 м. Рост корней продолжается до начала образования семян.
Наиболее интенсивно они растут в период от ветвления до цветения. Азотфиксирующие бактерии проникают в корни сои через корневые волоски, в месте проникновения из разрастающейся ткани корня через 7-12 дней после появления всходов образуются клубеньки.