Репродуктивные органы у подсолнечника начинают формироваться очень рано. В фазе третьей пары настоящих листьев, то есть через 18-20 дней после появления всходов, вытягивается конус нарастания. В фазе шестой-седьмой пары листьев образуются цветковые бугорки, определяется количество цветков в корзинке. В этот период растения испытывают повышенную потребность в освещении, минеральном питании, влаге.
В неблагоприятных условиях корзинка формируется мелкой с небольшим количеством цветков.
Фаза бутонизации (начало образования корзинки) наступает через 35-40 дней после всходов. В этот период масса листьев равна массе стебля.
Во время цветения рост стебля в высоту прекращается и усиливается рост корзинки, масса которой к наступлению полной спелости составляет половину массы растения.
Цветение наступает через 55-70 дней после всходов или через 20-30 дней после начала образования корзинки. Первыми раскрываются язычковые цветки, которые служат для привлечения насекомых. Одновременно усиленно растут цветоложе и трубчатые цветки. На второй день начинают раскрываться трубчатые цветки, цветение которых в корзинке происходит ярусами - от периферии к центру. Раскрываются цветки обычно утром и вечером. Продолжительность цветения каждого цветка 1-2 дня, корзинки-8-10 дней, а всего поля-15-20 дней.
Рыльце пестика сохраняет восприимчивость к пыльце до 10 дней. Пыльца остается жизнеспособной более длительное время.
Наибольшее количествоцветков раскрывается на 2-3-и день цветения.
В корзинке образуется от 600 до 1200 цветков. Опыляется подсолнечник перекрестно посредством насекомых и ветра. Пыльца переносится ветром на расстояние до 200-250 м.
При неблагоприятных погодных условиях (затяжные дожди, почвенная и воздушная засуха, высокая температура воздуха) не все цветки опыляются, отмечается пустозерность, как правило, в центре корзинки, что снижает урожай семян и их качество. Оптимальные условия для цветения и оплодотворения подсолнечника создаются при температуре 20-25°С, солнечной погоде и умеренной относительной влажности воздуха.
Минимальная температура воздуха в период цветения 5-10°С, при более низкой температуре пыльца не прорастает.