Калийные удобрения под лен вносят осенью или рано весной по 60-120 кг действующего вещества на 1 га с учетом содержания калия в почве. Чтобы получить льняное волокно хорошего качества, необходимо применять азотные, фосфорные и калийные удобрения под лен в определенном соотношении.
Исследования различных авторов, обобщенные А. Д. Костюченко и Н. 3. Станковым, показали, что на фоне хороших предшественников азот, фосфор и калий следует вносить под лен в соотношении 1:3: 3. При посеве льна на слабоокультуренных почвах и по удовлетворительным предшественникам это соотношение будет более узким- 1 : 2 : 2.
Доказана высокая эффективность применения под лен ряда сложных и комплексных удобрений - аммофоса, полифосфата аммония и других.
Для создания выровненного стеблестоя льна необходимо особое внимание уделять равномерному распределению удобрений на поле. Под основную вспашку и перед посевом их вносят тщательно отрегулированными сеялками СТН-2,8, разбрасывателями РТТ-4,2А, 1РМГ-4 и др.
Большое влияние на урожайность и качество льна-долгунца оказывают микроэлементы - бор, медь, кобальт, сера, молибден, железо. При расчете доз микроудобрений используют данные агрохимических лабораторий.

Микроудобрения применяют для внесения в почву, предпосевной обработки семян или некорневой подкормки растений.
На известкованных дерново-подзолистых и дерново-глеевых почвах растения льна испытывают недостаток в боре и хорошо отзываются на внесение борных микроудобрений. Бор оказывает на растения благоприятное физиологическое действие и предохраняет их от заболевания бактериозом.
Под предпосевную культивацию вносят бормагниевые удобрения - 20- 30 кг/га, борный суперфосфат - 200-300 кг/га или 25-50 кг/га в рядки при посеве.